En el AM1, Dewar modifica la repulsion entre cores, con la expresión:
donde
caria entre 2 y 4, dependiendo del átomo, y se parametrizo para los elementos:
H, B, C, N, O, F Al, Si, P, S, Cl, Zn, Ge, Br, I y Hg.
(Ver pag 88 del libro indicado arriba sobre sus limitaciones)
El ajuste del AM1 se hizo manualmente, en esencia, Stewart lleva a cabo el ajuste usando un proceso automático, optimizando todos los parametros simultaneamente. dando lugar al PM3, que sería el método cpon mejores ajustes para los datos experimentales considerados. Se ajusto para: H, Li, C, N, O, F, Mg, Al, Si, P, S, Cl, Zn, Ga, Ge, As, Se, Br, Cd, In, Sn, Sb, Te, I, Hg, Tl, Pb, Po y At.