La consideración de la simetría en la geometría del sistema a estudiar, y en la función de onda que se busca es muy importante para la simplificación de los cálculos y el análisis de los resultados.
Algunos programas (Gamess), para cálculos más sofisticados que los HF, p.e. GVB, no permiten el uso de la simetría, e incluso, aunque no lo digan, para sistemas capa abierta, donde la densidad de carga electrónica no es totalmente simétrica, hay que cuidar mucho el empleo de la simetría.
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