En el año 1945 es nombrado Profesor encargado de Cátedra de la Universidad de Salamanca, y al año siguiente se doctora en Filosofía y Letras por la Universidad de Madrid, con la calificación de “Sobresaliente” y Premio extraordinario. Obtuvo el Premio “Menéndez Pelayo” de investigación del CSIC por su obra El habla del campo de Jaca, y tras la oposición al cargo de Profesor adjunto de “Gramática histórica de la Lengua española” en la Universidad de Salamanca consigue la mencionada adjuntía. 

En 1948 es nombrado Catedrático de “Gramática histórica de la Lengua española” por oposición en la Universidad de Granada, y al año siguiente es designado colaborador del Instituto “Miguel de Cervantes” del CSIC y redactor de la Revista de Filología Española. Ha impartido su magisterio en la Universidad Autónoma de Madrid y en la Universidad Complutense. 

Hoy, casi medio siglo después, cabe destacar su tolerancia, vocación, docencia y multitud de cursos y conferencias en Alemania (Erlangen, Bonn, Heidelberg y Göttingen), Estados Unidos, Méjico, Puerto Rico, Brasil, Colombia, Argentina, Ecuador, Perú, Holanda, Bélgica, Suiza, Austria, Italia, Francia, Marruecos, Cuba, Santo Domingo, Japón y China. 

Es Profesor Honorario de la Universidad Mayor de San Marcos de Lima y Miembro Honorario de la American Association of Teachers of Spanish and Portuguese, de The Modern Language Association of America y del Instituto Caro y Cuervo de Bogotá. Además, es Miembro de Honor de la Société de Linguistique Romane, de la Institución Internacional de Cultura de Corea y de la Asociación de Hispanistas de Japón, así como Académico de Número de la Real Academia Española y Miembro Correspondiente de la Academia de Gustavo Adolfo de Uppsala, de la Lengua de Bogotá, de la Historia de Boyacá, de Buenas Letras de Barcelona y de The Hispanic Society of America. 

Ha sido dos veces galardonado con los premios “Nacionales de Investigación” del CSIC, y ha obtenido los premios “Antonio de Nebrija”, “Nacional de Literatura” y el “Award Excellence in Research” (State University of New York). Asimismo, ha recibido la Encomienda con placa de la Orden de Alfonso X el Sabio y la Gran Cruz de la Orden de Alfonso X el Sabio. 

Es Doctor honoris causa por las Universidades de Burdeos, Pisa, Valencia, Granada, Zaragoza, Salamanca, Valladolid, La Laguna, Sevilla, Málaga y UNED, entre otras. Ha sido director de la Real Academia Española y Secretario general del OFINES. Actualmente, es Consejero del CSIC y dirige la Revista de Filología Española, Lingüística Española Actual y Archivo de Filología Española. 
 Su obra científica abarca más de seiscientos títulos, con un centenar largo de libros. Recientemente, ha merecido el reconocimiento de los investigadores de todo el mundo en los cuatro volúmenes titulados Philologica hispaniensia in honorem Manuel Alvar. Finalmente, la “Institución Fernando el Católico” de Zaragoza ha creado la “Cátedra de Lingüística Manuel Alvar”.